為加快推進太湖流域水環境綜合治理水利項目實施，確保《太湖流域水環境綜合治理總體方案》確定的水利工作目標如期完成，水利部會同江蘇省、浙江省、上海市人民政府成立了太湖流域水環境綜合治理水利工作協調小組。8月1日，太湖流域水環境綜合治理水利工作協調小組第一次會議在上海召開。水利部副部長矯勇主持會議并講話。江蘇省委常委、副省長黃莉新，浙江省副省長茅臨生，上海市副市長沈駿，全國政協委員、水利部原副部長、太湖流域水環境綜合治理專家咨詢委員會副主任翟浩輝出席會議并講話。
會議主要目的是建立流域水環境綜合治理水利工作協調機制，進一步研究明確太湖流域水環境綜合治理中水利工作的職責和任務，研究落實有關太湖流域水環境工作進度計劃，全面推進太湖流域水環境綜合治理水利工作，確保《總體方案》順利實施完成。
2007年5月，太湖藍藻暴發引發無錫市供水危機后，國務院高度重視太湖流域水環境綜合治理。根據國務院部署，國家發改委會同江蘇、浙江、上海兩省一市人民和水利部、建設部、環保部等有關部門組織編制了《太湖流域水環境綜合治理總體方案》。2008年4月2日，國務院常務會議審議通過了《總體方案》，5月7日，國務院正式批復了《總體方案》。為加強對太湖流域水環境綜合治理工作的組織協調，國務院批復成立了太湖流域水環境綜合治理省部際聯席會議制度。
會議對太湖流域水環境綜合治理水利工作進行了梳理，原則同意《太湖流域水環境綜合治理主要水利職責分工及近期工作安排》，討論通過《太湖流域水環境綜合治理水利工作協調小組會議紀要》，明確了兩省一市和太湖流域管理局在水源地保護、引江濟太、水體監測、藍藻打撈合作機制、流域水功能區劃、污染物總量控制、底泥疏浚、引排工程、河網整治、太湖管理條例等方面的職責分工和進度安排。
會議強調要加大推進太湖流域水環境綜合治理水利工程的前期工作，以現有規劃為基礎，從流域層面上統籌考慮各單項工程的功能、任務、定位、布局，統籌處理好提高水環境容量、改善水環境與保障防洪安全與水資源供給之間的關系，各有關單位要狠抓有關水利工程的前期工作。兩省一市要切實做好征地、移民等相關工作，力爭走馬塘拓浚延伸工程、望虞河西岸控制工程、太浦閘除險加固工程、望亭水利樞紐改造工程、新孟河延伸拓浚工程、新溝河延伸拓浚工程、常熟水利樞紐改造工程、太湖流域水資源監控及保護預警系統等項目在完善前期工作的前提下，于今明兩年盡早開工建設。
太湖流域水環境綜合治理水利工作協調小組成員、協調小組辦公室成員，流域各省市及有關部門的負責人和其他代表共80余人參加會議。
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